O Departamento de Matemática alberga o Centro de Matemática da Universidade do Porto (CMUP), um dos maiores do país, que semanalmente promove a realização de várias atividades. O CMUP congrega matemáticos de toda a Universidade do Porto, muitos dos quais do Departamento de Matemática, e tem sido classificado como Excelente em todas as avaliações levadas a cabo pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia desde 2000. Há também docentes integrados noutras unidades de investigação: Centro de Astrofísica da Universidade do Porto (CAUP), Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores Investigação e Desenvolvimento em Lisboa (INESC-ID), Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores, Tecnologia e Ciência (INESC-TEC), Laboratório de Inteligência Artificial e Apoio à Decisão (LIAAD).
O Departamento de Matemática é também um dos promotores de dois dos programas de doutoramento de maior sucesso em Portugal:
- Programa Interuniversitário de Doutoramento em Matemática (em colaboração com a Universidade de Coimbra);
- Programa de Doutoramento em Matemática Aplicada (em colaboração com as Universidades de Aveiro, Beira Interior e Minho).
Em 2022/2023 terá início o Doutoramento em Matemática e Aplicações, uma colaboração transfronteiriça, favorecida pela afinidade cultural,que reúne competências científicas de várias instituições e centros de investigação prestigiados da Galiza e Norte de Portuga
A FCT tem concedido um conjunto de bolsas que são diretamente administradas por cada um dos programas, o que muito tem contribuído para a grande diversidade cultural do Departamento de Matemática, onde coexistem atualmente mais de uma dúzia de nacionalidades.
